Posee una arquitectura medieval única, así como valiosos frescos, y está incluida en la lista del Patrimonio de la UNESCO.
La iglesia fue construida en tres etapas. La más temprana es del siglo X, cuando el ala este fue fundada. El ala central se construyó en el siglo XII, y a principios del siglo XIX se completó el ala oeste. Los frescos en la iglesia de Boyana son un excepcional ejemplo del arte europeo y búlgaro. Existen tres capas de frescos en los muros de la iglesia : El primero data del siglo XI-XII , son de colores vivos, hechos con la técnica “fresco” típica del periodo. La segunda capa es del año 1259. En las inscripciones está anotado el año y el nombre del mecenas, el noble caballero Kaloyan Sebastocrator. Las murallas de este período son impresionantes – más de 240 figuras, pintadas por un artista anónimo, y todas son vívidas, individuales, cada una con su presencia, son las primeras y únicas pinturas realistas en Europa precediendo el Renacimiento europeo. La tercera y última capa de pinturas (siglos XIV, XVI-XVII y XIX) son interesantes temas religiosos, las dos más valiosas son las imágenes de los santos San Nicolás y San Panteleimón, muy respetados en esta región. La visita a la iglesia de Boyana está incluida en cada recorrido cultural e histórico de Bulgaria.